MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM100

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010008	TCA	2	6	149	154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161353807
2	NC_010008	ATA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353807
3	NC_010008	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	161353807
4	NC_010008	ACAAA	2	10	448	457	80 %	0 %	0 %	20 %	294672671
5	NC_010008	GCT	2	6	479	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294672671
6	NC_010008	GGAA	2	8	486	493	50 %	0 %	50 %	0 %	294672671
7	NC_010008	A	7	7	541	547	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
8	NC_010008	ATT	2	6	549	554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672671
9	NC_010008	AAAT	2	8	615	622	75 %	25 %	0 %	0 %	294672671
10	NC_010008	ACA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
11	NC_010008	A	6	6	693	698	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
12	NC_010008	TCT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672671
13	NC_010008	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
14	NC_010008	GT	3	6	771	776	0 %	50 %	50 %	0 %	294672671
15	NC_010008	ACA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672671
16	NC_010008	TAAA	2	8	798	805	75 %	25 %	0 %	0 %	294672671
17	NC_010008	A	6	6	803	808	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
18	NC_010008	A	6	6	834	839	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
19	NC_010008	TAG	3	9	841	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
20	NC_010008	TGA	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
21	NC_010008	ATA	2	6	888	893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
22	NC_010008	CGA	2	6	904	909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294672671
23	NC_010008	CAAA	2	8	1007	1014	75 %	0 %	0 %	25 %	294672671
24	NC_010008	GTA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
25	NC_010008	ACAA	2	8	1066	1073	75 %	0 %	0 %	25 %	294672671
26	NC_010008	ATG	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672671
27	NC_010008	AGA	2	6	1093	1098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672671
28	NC_010008	AAT	2	6	1109	1114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
29	NC_010008	A	6	6	1134	1139	100 %	0 %	0 %	0 %	294672671
30	NC_010008	TAA	2	6	1190	1195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294672671
31	NC_010008	GAA	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353809
32	NC_010008	AACG	2	8	1251	1258	50 %	0 %	25 %	25 %	161353809
33	NC_010008	AAC	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353809
34	NC_010008	T	6	6	1382	1387	0 %	100 %	0 %	0 %	161353809
35	NC_010008	A	6	6	1440	1445	100 %	0 %	0 %	0 %	161353809
36	NC_010008	AGAACA	2	12	1505	1516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	161353809
37	NC_010008	C	6	6	1527	1532	0 %	0 %	0 %	100 %	161353809
38	NC_010008	GGA	2	6	1568	1573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353809
39	NC_010008	GAAC	2	8	1625	1632	50 %	0 %	25 %	25 %	161353809
40	NC_010008	A	8	8	1676	1683	100 %	0 %	0 %	0 %	161353809
41	NC_010008	GCT	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161353809
42	NC_010008	GTAA	2	8	1704	1711	50 %	25 %	25 %	0 %	161353809
43	NC_010008	A	9	9	1710	1718	100 %	0 %	0 %	0 %	161353809
44	NC_010008	TGG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161353809
45	NC_010008	TAA	2	6	2399	2404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161353810
46	NC_010008	T	6	6	2459	2464	0 %	100 %	0 %	0 %	161353810
47	NC_010008	TCT	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161353810
48	NC_010008	GA	3	6	2562	2567	50 %	0 %	50 %	0 %	161353810
49	NC_010008	T	6	6	2571	2576	0 %	100 %	0 %	0 %	161353810
50	NC_010008	CCTA	2	8	2719	2726	25 %	25 %	0 %	50 %	161353810
51	NC_010008	TCA	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
52	NC_010008	ATC	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
53	NC_010008	CTT	2	6	2880	2885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
54	NC_010008	CTT	2	6	2889	2894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672672
55	NC_010008	GAT	2	6	2940	2945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672672
56	NC_010008	GAA	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
57	NC_010008	TACTC	2	10	3056	3065	20 %	40 %	0 %	40 %	294672672
58	NC_010008	TGT	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672672
59	NC_010008	GAA	2	6	3100	3105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294672672
60	NC_010008	GGT	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294672672
61	NC_010008	CTA	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672672
62	NC_010008	CTTT	2	8	3989	3996	0 %	75 %	0 %	25 %	294672673
63	NC_010008	CAT	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672673
64	NC_010008	CTGG	2	8	4076	4083	0 %	25 %	50 %	25 %	294672673
65	NC_010008	GTT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294672673
66	NC_010008	TTC	2	6	4150	4155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294672673
67	NC_010008	T	7	7	4195	4201	0 %	100 %	0 %	0 %	294672673
68	NC_010008	GAG	3	9	4471	4479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161353813
69	NC_010008	AAG	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
70	NC_010008	CAA	2	6	4615	4620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
71	NC_010008	A	6	6	4636	4641	100 %	0 %	0 %	0 %	161353813
72	NC_010008	AAG	2	6	4661	4666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161353813
73	NC_010008	CAA	2	6	4702	4707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161353813
74	NC_010008	CCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
75	NC_010008	CAC	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161353813
76	NC_010008	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	161353813
77	NC_010008	T	7	7	5014	5020	0 %	100 %	0 %	0 %	294672674
78	NC_010008	ATT	3	9	5025	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294672674
79	NC_010008	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
80	NC_010008	CAT	2	6	5136	5141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294672674
81	NC_010008	GGGA	2	8	5154	5161	25 %	0 %	75 %	0 %	294672674
82	NC_010008	ACA	2	6	5192	5197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294672674
83	NC_010008	ATG	2	6	5229	5234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674
84	NC_010008	GAT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294672674

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.